Saison 1 : Elle raconte l'histoire peut ordinaire d'un adolescent, Kyle, qui a été retrouvé errant dans la rue complètement nu. En apparence comme les autres, Kyle a les réactions d'un nouveau né qui semble découvrir le monde. Doté de performances intellectuelles hors du commun, Kyle est un adolescent amnésique qui va trouver refuge chez la famille Trager, et tenter de savoir qui il est et d'où il vient. Mais il ne s'attend pas aux réponses qu'il va avoir...
Saison 2 : partie 1 : Après que Kyle ait cherché à en savoir plus sur son passé, il va enfin pouvoir obtenir des réponses de la part d'un certain Adam Baylin qui en vain meurt, c'est donc avec l'aide de Tom Foss qu'il devrait désormais apprendre quelles sont ses capacités et et les garder secrètes vis-à-vis des membres de la famille Trager .Un nouveau personnage arrive au cours de la saison 2, elle s'apelle Jessi XX, le Kyle version femme mais plus perfectionné. Des membres de Madacorp (la société secrète qui a fabriqué Kyle & Jessi) capable de la diriger finiront par l'insérer dans la famille Trager pour qu'elle puisse prendre les données secrètes que Kyle a en lui.
Saison 2 : partie 2 : Dans cette suite, Kyle dira enfin la vérité sur son identité à sa famille adoptive, les Trager. Il leur expliquera d'où il vient. Ensemble, ils décideront de s'allier contre Madacorp, la compagnie de l'ombre qui a tenté de prendre le contrôle de Kyle et Jessi. Dans le dernier épisode de la mi saison 2, on a vu Jessi faire le grand saut mais elle s'en sortira